Team NINJA Logos são uma espécie de cartão grande que ficam escondidos no jogo e servem para restaurar sua capacidade de life e NINPO's. No total há 3 no jogo, dois dele você pode pegar a qualquer momento (se já estiver no capítulo 18) e um pode ser perdido de forma a não ter mais volta a não ser que você recomece o jogo do zero, então fique atento a localização deles.
O primeiro está na frente do “Han's Bar”. Veja a localização neste vídeo:
O segundo está na área onde você tem de enfrentar 2 tanks de guerra, logo após uma outra área com uns vagões de trem e antes de enfrentar um helicóptero. Depois de vencer a luta contra os 2 tanks vá para o canto extremo a esquerda do elevador (não suba o elevador) e estará lá bem camuflado no fim do beco. Esse é o que não será possível pegar a qualquer momento pois quanto o episódio acabar o caminho para cá será bloqueado para sempre.
O último se encontra no topo da torre do finalzinho do capítulo 18. Estará logo ao lado direito do ponto de save. Após pegar esse o troféu é seu.