Pedras preciosas estão espalhadas pelos distritos, principalmente nos telhados dos prédios, porém há um grande número de pedras que ficam debaixo da cidade. Toda vez que liberar um distrito, explore tanto em cima quanto embaixo da cidade para coletar o máximo de pedras preciosas possíveis. Após o episódio 15, uma nova leva de pedras estará disponível em todos os distritos e planos especiais. Derrotar os navis raros rende uma boa quantidade de pedras também, assim como conseguir medalhas de ouro nos desafios. Derrotar navis normais não rende pedras, salvo raras exceções.
