Cada missão secundária mostra as facções afetadas (positivamente e negativamente).
É preciso completar uma série de missões de uma das facções piratas até ela ficar neutra. Além disso, enquanto a facção escolhida for inimiga, é preciso fugir das batalhas, pois cada nave destruída diminui os pontos.
Recomendo buscar esse troféu já no primeiro sistema, pois vai ser bem mais fácil.