Uma coisa que ajuda bastante é você ir ao menu do backpack e retirar a faca do seu inventário de armas (aquele inventário que aparece in-game quando se aperta ). Feito isso, não corre o risco de cortar a garganta do inimigo por acidente - o que também rende outro troféu =)
Feito isso, é só chegar na surdina atrás de um inimigo, e quando ele perceber sua presença, seja rápido: vá na direção dele e segure o botão próximo dele, apontando o analógico da esquerda na direção em que esse inimigo está.