O jogo tem quatro finais diferentes, sendo que para conseguir acesso a dois deles você deve, na ultima missão em Panchae, salvar o David Sarif e o William Taggart.
Os finais são:
Transmitir a mensagem do Hugh Darrow Transmitir a mensagem do William Taggart Transmitir a mensagem do David Sarif Explodir Panchea (vire a esquerda na sala com os paineis e vai achar um quarto painel)
Sempre que acabar o jogo (para esse troféu pode pular os créditos). Você pode escolher a opção Continue e vai estar novamente na frente do painel com as opções. Se salvar e voltar no save, o jogo não conta o final, tem que usar o Continue.
