Como ninguém comentou sobre e foi uma dúvida que me ocorreu, caso você zere o game e não conquiste esse troféu, você pode sim selecionar os capítulos em que os mesmos estão e achar eles (carroças de alquimistas), não sendo necessário uma segunda jogada em toda campanha. Eu aconselho pegar pelo menos um item dos que estão dentro por precaução para o jogo assimilar a interação com o local e logo após seguir pelo menos até o próximo checkpoint antes de partir para o próximo. Eles estão no capítulo 7,9,10,12 e 16.
Edit: Só precisa ir atrás dos que não foram encontrados.