Alguns espíritos você só pega de forma específica, como completando Sidequest, ou em eventos aleatórios que ocorrem no mundo (um deles é um que os espíritos ficam presos em umas “caixas” e os visitantes vem querer drenar, você precisa protegê-las e a outra é o Hyakki Yako ou o“desfile dos visitantes”, você presencia um na cutscene logo no começo, uma nevoa passando com vários inimigos passando). Na minha jogatina apareceram poucos Hyakki Yako, quando só faltava estes espíritos, eu consegui encontrar eles da forma que explica no link abaixo:
Para os espíritos espalhados pela cidade, tem um juzu (pulseira) que você equipa no Akito, o Juzu Sensitivo, que indica a direção de onde há espirito para coletar num raio de 100 ou 200m. Você consegue ver em quais regiões falta coletar espíritos pelo mapa consultando os portões Torii.
Caso queria platinar de primeira, sugiro fazer este trófeu no capítulo 4, onde você já tem acesso a todo o mapa.
Toda vez q aparecer um hyakki yakou, eu aconselho a tentar fazer; fui evitando de fazer e quando tinha limpado todo o mapa, fico faltando uns 15000, cada hyakki q vc faz dropa em media 1000 e o rng n foi legal comigo; então demoro e foi chato fica caçando, por isso se aparecer no meio da side/enquanto estiver limpando o mapa FAÇA